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冻干是一个升华干燥为主的干燥工艺，升华干燥去除了90%~95%的水分，是主要的阶段，因此升华的效率非常关键。升华过程中有升华的动力，也有升华的阻力。升华过程中的阻力主要来自以下几个方面：

容器的阻力，如瓶壁，瓶塞，比如西林瓶的选择不同的瓶塞，阻力大小不一样，同样的制品采用的瓶塞不一样，升华的效率也会有差别。一般三叉和单叉的阻力较小，优于双叉。

机器本身的阻力，如冻干箱到冷阱之间的管道阀门的阻力，一般管道粗阻力小，管道直阻力小，管道细有弯阻力大。也有冻干箱与冷阱的分布方式有关，如水平方式和垂直或者后置的方式排布阻力是不一样的。

干燥部分的阻力。升华是一个从表及里，从外而内，从上面到下面的过程。升华界面是逐渐下移的，因此已经干燥部分的空隙是升华的蒸汽的通道。干燥后的孔隙的大小和分布的方式影响升华的效率。如果是大通道，一般升华阻力小，蒸汽能迅速通过通道升华，如果是孔隙小，通道无规则，那么升华阻力大，升华效率低。而升华中的阻力的主要来源就是升华的通道，也就是干燥部分，这个部分阻力占到总阻力的80%~90%。因此为什么说预冻比较重要，因为预冻形成的冰晶大小是升华阶段的升华通道，因此控制预冻的速率对升华的影响很大。因此提高效率的话，就要控制合适的冰晶粒径。太大的话，冻干后复水慢，可能活性物质还会失活，如果太小的话，升华效率低，影响冻干的成本，因此要兼顾效率成本和冻干制品的质量选择合适的预冻效率。